Já falamos aqui sobre os emuladores de Super Nintendo e Mega Drive. Agora é hora de falar um pouco sobre o emulador de Nintendo 64, o Mupen64.
Para começar, esse talvez seja o emulador mais fácil de se utilizar no Linux, uma vez que basta descompactar, executar, configurar e sair jogando, simples assim!
O Mupen64 pode ser encontrado em: http://mupen64.emulation64.com/down.htm
Depois de baixar, basta descompactar, entrar na pasta criada e executar o arquivo "mupen64" dentro da mesma. Simples e rápido!
Existe até mesmo uma versão para ser compilada e tudo mais, entretanto, a versão "descompacte e jogue" me pareceu bem mais prática. O emulador já acompanha alguns plug-ins para vídeo, som e controles. Abaixo, a tela principal do emulador:
Em "Options" podemos configurar os plug-ins de som, vídeo e controles (até 4), além de indicar o local onde então as roms. Feito isso, as roms aparecem listadas na janela principal do programa, bastando escolher uma e jogar. Veja alguns jogos rodando nele:

Super Mario 64

Star Fox 64
Pode ser que haja queda na qualidade das imagens, dependendo do plug-in de vídeo que estiver usando. O ideal é ir testando até achar um que mais lhe agrade.
Boa diversão